運行中電磁流量計的故障，常常由流量傳感器內壁附著層、雷電電擊和環境條件變化等因素引起的。如果電磁流量計在使用過程中出現流量負值，就很有可能有幾種原因，下面就來分析下：
1、電磁流量計傳感器沒按流向標識安裝，造成流量反向測量，此時瞬時流量為負數。解決方案：重新安裝電磁流量計，按照傳感器流向標識。
2、流量傳感器的信號線反接，電磁流量計具有正反向測量的功能，所以會顯示反向流量。解決方案：可將傳感器信號線調換正確連接。
3、測量管道空管或液體沒充滿管，有氣體、氣泡存在。這時會顯示負數或流量值忽大忽小的現象。解決方案：可以采取縮經或傾斜安裝，讓管道內充滿被測介質，可以讓流量計具備測量條件。
經儀表研究，電磁流量計的流量負值還有個情況。當閥門打開時，瞬間流量會使管道液體回流，出現負值的情況。